La gamme 5400 comprend deux modèles 6 cylindres : les 5465 et 5475. Ces modèles disposent du moteur Agco Sisu Power 66CTA de 6,6 l. Ces tracteurs sont équipés de série de la transmission semi-powershift Dyna-4, à quatre gammes mécaniques et quatre rapports sous charge. La gestion de boîte intègre la fonction Speedmatching, qui sélectionne le rapport le plus approprié à la vitesse d'avancement lors d'un changement de gamme. En actionnant un bouton placé sur le levier de la console à droite, il est également possible de passer les quatre gammes sans actionner la pédale d'embrayage. La boîte peut recevoir en option des vitesses rampantes (soit 24 AV/24 AR) pour rouler au minimum à 0,50 km/h ou super-rampantes (soit 32 AV/32 AR) pour descendre jusqu'à 0,14 km/h à 2 200 tr/min.
Point de vue confort, ces deux tracteurs peuvent recevoir un pont avant suspendu. Le constructeur va même plus loin en proposant une suspension mécanique. Le système repose sur deux Silentbloc à l'avant de la cabine et deux ensembles amortisseur-ressort à l'arrière. Deux bielles Panhard améliorent la stabilité horizontale de la cabine.